Основными задачами Управления являются:

        - обеспечение реализации единой политики управления и государственного контроля в сфере использования природных ресурсов и охраны окружающей среды, обеспечения экологической безопасности; - государственный контроль за соблюдением требований законодательства республики в области охраны природы, соблюдением норм экологической безопасности со стороны юридических и физических лиц, независимо от форм собственности, подчиненности и принадлежности; - государственный контроль за рациональным использованием и охраной подземных и надземных недр, земель, водных ресурсов, атмосферного воздуха, животного и растительного мира, в том числе биоразнообразия, охраны окружающей среды, обращением с производственными и бытовыми отходами (за исключением радиоактивных отходов), состоянием и использованием лесов; - изучение и анализ состояния окружающей среды, возникновения и развития экологических явлений и процессов, организация проведения систематического аналитического контроля за состоянием окружающей среды; - комплексная оценка и прогнозирование состояния окружающей среды и использования природных ресурсов на основе собранных в результате деятельности информации, обеспечение государственных органов, организаций и населения экологической информацией; - контроль за выполнением мероприятий, направленных на обеспечение охраны, оздоровление и улучшение качества окружающей природной среды, рациональное использование природных ресурсов, сохранение особенностей развития окружающей среды, использование и охрана лесных угодий, природных комплексов, и объектов, имеющих особый природный, научный, культурный и рекреационный характер; - в пределах своей компетенции сотрудничать и содействовать выполнению обязательств, принятых Республикой Таджикистан, по международным конвенциям, договорам и соглашениям; - содействие привлечению инвестиций для охраны и оздоровление окружающей природной среды и рационального использования природных ресурсов; - согласно действующему законодательству организация контроля за ввозом, вывозом, производством и использованием, хранением и реализацией минеральных удобрений и ядохимикатов, биологических средств роста растений, сырья, в том числе материалов вторичного использования, новой техники и технологии; - участие в разработке стратегий, концепций, программ и планов по рациональному использованию природных ресурсов и охраны окружающей природной среды области; - с участием других уполномоченных государственных органов определение основных направлений использования природных ресурсов, охраны окружающей природной среды и обеспечение экологического равновесия, организация контроля и предотвращение ухудшения состояния природы; - подготовка отчетов о состоянии окружающей среды и рациональном использовании природных ресурсов области; - планирование и осуществление научно – исследовательских и проектно – изыскательских работ, осуществление в пределах своих полномочий и компетенций функции государственного заказчика и исполнителя; - в установленном порядке осуществление деятельности по лицензированию, определению нормативов использования и загрязнения окружающей природной среды, в том числе выдача лицензий на обращение с опасными отходами, использование объектов животного и растительного мира, и выдача разрешений на использование природных ресурсов земли, лесов и вод, в том числе бурение скважин на воду, сбросов загрязняющих веществ в водные источноки и выбросов в атмосферный воздух, размещение промышленных и бытовых отходов, материалов вторичного использования, составление и пополнение зоологических коллекций; - в случае нарушений природопользователями требований и условий, установленных в разрешениях и лицензиях, приостановление или аннулирование их действия; - в установленном порядке представление предложений по установлению квот по использованию отдельных видов объектов животного и растительного мира, ввозу в республику опасных для окружающей среды веществ; - выдача экологических заключений на выбор участков земли, размещение объектов, осуществление хозяйственной и иной деятельности на условиях выполнения требований действующего законодательства в области охраны природы; - согласование предложений по выбору мест и проектов строительства и реконструкция объектов, материалов по проведению строительных, взрывных, подводных и других работ на водных объектах и их прибрежных полосах (зонах), захоронению (складированию) всех видов отходов, осуществлению планов работ на карьерах общераспространенных полезных ископаемых, влияющих на состояние охраны природной среды